Św. Józef Sebastian pozostawił po sobie bogatą spuściznę pisarską. W swojej działalności literackiej i kaznodziejskiej z ogromną erudycją ukazywał praktyczne – duszpasterskie implikacje zdobytej wiedzy.

Jak sam wyznał:
Było gorącym moim pragnieniem służyć Bogu także piórem i podzielić się [...] tym, co jako kapłan i biskup poznałem i czego jako profesor w Przemyślu i Krakowie uczyłem, aby w ten sposób zużytkować wszystkie dary wzięte od Boga i nawet po śmierci być ludziom użyteczny.

Pośród prac wydanych drukiem w skład pism św. Józefa Sebastiana wchodzą dzieła teologiczne, historyczne, książki z dziedziny  prawa kanonicznego, listy pasterskie, kazania, mowy okolicznościowe, mowy żałobne, akta normatywne, podręczniki, modlitewniki, i inne. Oprócz nich w formie rękopisów zachowały się zapisy kronikarskie, korespondencja, kazania, mowy, toasty i inne znajdujące się w Archiwum Głównym Zgromadzenia Służebnic Najświętszego Serca Jezusowego w Krakowie. W wykazie rękopisów zachowano układ rzeczowy z dokładnym wyszczególnieniem rękopiśmiennych kazań i mów, natomiast w dziale korespondencja nie wymieniono poszczególnych listów, a tylko cały ich zbiór.